115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3705 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  100 
 
 		 341 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  79.71 
 
 		 341 aa  594  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  80.65 
 
 		 342 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  79.47 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  79.18 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  79.18 
 
 		 342 aa  584  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  77.94 
 
 		 341 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  79.41 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  79.18 
 
 		 342 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  79.47 
 
 		 342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  78.82 
 
 		 341 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  77.42 
 
 		 342 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  77.71 
 
 		 342 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  76.83 
 
 		 342 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  76.61 
 
 		 342 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  77.06 
 
 		 345 aa  564  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  71.47 
 
 		 341 aa  521  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  67.74 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  65.59 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  64.12 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  65 
 
 		 339 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  64.12 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  66.47 
 
 		 349 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  64.99 
 
 		 349 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  64.12 
 
 		 340 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  61.31 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  58.43 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  39.47 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.78 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  34.73 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.72 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.09 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.35 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.71 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.97 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.09 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.9 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  28.92 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  33.82 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  23.7 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.3 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.09 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.99 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  22.82 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  22.82 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  22.87 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.95 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.89 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.4 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  20.46 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.38 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  21.63 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  22.86 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.75 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  25 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  23.13 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>