185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1256 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  80.21 
 
 		 283 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  75.99 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  42.75 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  39.06 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  36.24 
 
 		 387 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  35.51 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.87 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.48 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.82 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  24.76 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 336 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 336 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  24.43 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  24.43 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  24.76 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.19 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.11 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  22.7 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.64 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.01 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  24.13 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.41 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25.17 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  25 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  23.02 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  24.28 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.1 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  24.3 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  21.92 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  21.85 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.45 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.9 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  22.07 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  24.75 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 355 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  22.34 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 341 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  23.99 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>