146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3521 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  100 
 
 		 361 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  91.84 
 
 		 336 aa  620  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  72.17 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.57 
 
 		 629 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  56.29 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  50.15 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  52.73 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  49.55 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  51.69 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  50.76 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  49.11 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  37.79 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  37.72 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  38.65 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.73 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  36.8 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.14 
 
 		 350 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.44 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.74 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  31.74 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  35.04 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.04 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.55 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  35.18 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.25 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 335 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  29.32 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.21 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 330 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.16 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.92 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  31.03 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.93 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.67 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.38 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  27 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.82 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.06 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  32.17 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  21.64 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.52 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.47 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  25 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>