228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0682 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 629 aa  1298    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  59.59 
 
 		 339 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  61.63 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  55.62 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.67 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  53.57 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  55.18 
 
 		 336 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  55.06 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  55.32 
 
 		 334 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  53.78 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  51.63 
 
 		 337 aa  333  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  37.61 
 
 		 345 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.13 
 
 		 342 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  45.9 
 
 		 264 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  42.76 
 
 		 293 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  40.88 
 
 		 291 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  41.18 
 
 		 279 aa  200  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.62 
 
 		 279 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  45.9 
 
 		 265 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  43.73 
 
 		 260 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.59 
 
 		 279 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  45.52 
 
 		 265 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.59 
 
 		 279 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.59 
 
 		 279 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  40.59 
 
 		 279 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.85 
 
 		 279 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  40.22 
 
 		 279 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  40.22 
 
 		 279 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  39.71 
 
 		 279 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.85 
 
 		 279 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.43 
 
 		 297 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  43.28 
 
 		 265 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  39.48 
 
 		 286 aa  187  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  46.86 
 
 		 267 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.38 
 
 		 284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  36.24 
 
 		 294 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.53 
 
 		 284 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.01 
 
 		 310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.91 
 
 		 285 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.28 
 
 		 311 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.98 
 
 		 289 aa  178  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.69 
 
 		 291 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.01 
 
 		 310 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  37.78 
 
 		 280 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  37.64 
 
 		 286 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.04 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.24 
 
 		 288 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.1 
 
 		 301 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.21 
 
 		 346 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.6 
 
 		 282 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.76 
 
 		 307 aa  171  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.87 
 
 		 353 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.1 
 
 		 311 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  37.87 
 
 		 311 aa  170  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  35.91 
 
 		 288 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  38.1 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  38.18 
 
 		 316 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.86 
 
 		 275 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.1 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.42 
 
 		 278 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  37.5 
 
 		 315 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.24 
 
 		 294 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.5 
 
 		 306 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.5 
 
 		 306 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.5 
 
 		 306 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.68 
 
 		 294 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  37.5 
 
 		 264 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.21 
 
 		 279 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  33.13 
 
 		 358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.21 
 
 		 286 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.52 
 
 		 279 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.12 
 
 		 351 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.03 
 
 		 320 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.86 
 
 		 323 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  36.13 
 
 		 276 aa  161  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  33.89 
 
 		 313 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  39.27 
 
 		 310 aa  158  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.43 
 
 		 291 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.34 
 
 		 339 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.81 
 
 		 316 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.81 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.81 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  33.55 
 
 		 313 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.79 
 
 		 310 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  35.51 
 
 		 372 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.86 
 
 		 301 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 333 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.45 
 
 		 350 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  35.16 
 
 		 354 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  35.71 
 
 		 299 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.8 
 
 		 312 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.94 
 
 		 383 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.23 
 
 		 282 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.08 
 
 		 286 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 323 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  33.96 
 
 		 279 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  33.79 
 
 		 273 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  36.68 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  34.94 
 
 		 262 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  33.33 
 
 		 298 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>