97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0709 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  100 
 
 
316 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  97.47 
 
 
353 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  97.44 
 
 
311 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  96.52 
 
 
315 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  97.12 
 
 
311 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  96.74 
 
 
306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  96.74 
 
 
306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  96.74 
 
 
306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  80.75 
 
 
320 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.15 
 
 
313 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.19 
 
 
316 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.53 
 
 
311 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  79.55 
 
 
313 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.53 
 
 
311 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  80.32 
 
 
310 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  75.72 
 
 
310 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  74.29 
 
 
311 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  75.08 
 
 
310 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  75.19 
 
 
294 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  71.04 
 
 
299 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  73.43 
 
 
278 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  70.14 
 
 
291 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  67.75 
 
 
294 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  66.43 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  66.43 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  70.9 
 
 
294 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  69.78 
 
 
301 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  69.4 
 
 
282 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  66.2 
 
 
289 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  67.91 
 
 
282 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  69.4 
 
 
286 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  65.38 
 
 
291 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  65.54 
 
 
279 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  61.19 
 
 
307 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  55.68 
 
 
279 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  56.06 
 
 
279 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.06 
 
 
279 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.68 
 
 
279 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.68 
 
 
279 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.68 
 
 
279 aa  315  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  50.7 
 
 
286 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.68 
 
 
279 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  55.68 
 
 
279 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.84 
 
 
279 aa  315  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  55.3 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  55.3 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.92 
 
 
279 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.33 
 
 
275 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  55.26 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  52.22 
 
 
276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.6 
 
 
323 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  53.01 
 
 
286 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.06 
 
 
282 aa  285  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.72 
 
 
285 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  49.47 
 
 
291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.5 
 
 
284 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  51.25 
 
 
282 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.75 
 
 
284 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  47.55 
 
 
301 aa  258  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  48.01 
 
 
297 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  50.38 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  43.85 
 
 
311 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  43.51 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  45 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  41.58 
 
 
286 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  40.15 
 
 
260 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  40.07 
 
 
295 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  42.42 
 
 
265 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  42.8 
 
 
265 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  42.42 
 
 
265 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  40.15 
 
 
273 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0143  tryptophan 23-dioxygenase  38.49 
 
 
298 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  38.81 
 
 
264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  36.6 
 
 
298 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3531  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.84 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.18 
 
 
629 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  36.25 
 
 
293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6248  tryptophan 23-dioxygenase  36.23 
 
 
294 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  36.5 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5416  tryptophan 23-dioxygenase  32.71 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  35.38 
 
 
262 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5980  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  32.18 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.85 
 
 
267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  24.35 
 
 
237 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02822  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.67 
 
 
362 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0410  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like  25.46 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0960  Tryptophan 2,3-dioxygenase  40.12 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_003296  RS01755  putative tryptophan-2,3-dioxygenase oxidoreductase protein  38.89 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0225  Tryptophan 2,3-dioxygenase  36.03 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1409  tryptophan 2,3-dioxygenase  33.83 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.932006  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1013  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  32.5 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0731  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  32.2 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0539  hypothetical protein  30.43 
 
 
236 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0260  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)  32.03 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02610  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  25.37 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  25.99 
 
 
441 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  26.96 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>