97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2498 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 313 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  98.4 
 
 		 313 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  92.06 
 
 		 320 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  94.86 
 
 		 311 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  93.99 
 
 		 316 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  94.86 
 
 		 311 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  92.68 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.33 
 
 		 353 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.65 
 
 		 311 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  81.65 
 
 		 311 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  80.7 
 
 		 315 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.03 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  79.55 
 
 		 316 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.03 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.03 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  80.13 
 
 		 310 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  81.61 
 
 		 311 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  78.78 
 
 		 310 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  69.48 
 
 		 291 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  75 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  68.85 
 
 		 294 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  68.79 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  69.13 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  71.22 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  68.56 
 
 		 294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  68.29 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  70.41 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  63.86 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  67.74 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  63.51 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  63.55 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  64.55 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  61.92 
 
 		 279 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  53.85 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  59.7 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.21 
 
 		 279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.85 
 
 		 279 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.85 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  53.85 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.85 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.85 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.07 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  54.55 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  53.48 
 
 		 279 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  53.48 
 
 		 279 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  57.14 
 
 		 280 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  53.79 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.11 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.23 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  52.38 
 
 		 276 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.68 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.72 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  53.01 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.79 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  50.18 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.11 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  48.3 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  50.55 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.38 
 
 		 284 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  49.25 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  48.5 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  40.74 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  41.15 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  40.84 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  41.13 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0143  tryptophan 23-dioxygenase  39.25 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  39.25 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  39.02 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  38.64 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.91 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  36.98 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  40.15 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  40.53 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  34.81 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3531  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.47 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  37.06 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  33.55 
 
 		 629 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6248  tryptophan 23-dioxygenase  36.6 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  38.26 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5416  tryptophan 23-dioxygenase  31.95 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5980  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  30.45 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  34.6 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.35 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  26.52 
 
 		 237 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0410  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like  26.24 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02822  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.09 
 
 		 362 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01755  putative tryptophan-2,3-dioxygenase oxidoreductase protein  37.41 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0225  Tryptophan 2,3-dioxygenase  36.8 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0960  Tryptophan 2,3-dioxygenase  38.13 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0539  hypothetical protein  24.91 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1409  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.75 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.932006  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1013  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  26.43 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0731  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  32.03 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02610  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  23.74 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  26.07 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0260  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)  31.25 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  25.78 
 
 		 409 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>