97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1862 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  62.5 
 
 
293 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  62.02 
 
 
267 aa  299  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  45.9 
 
 
629 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  46.51 
 
 
260 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  43.96 
 
 
265 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  43.51 
 
 
265 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  44.19 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  39.08 
 
 
280 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  40.46 
 
 
291 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.46 
 
 
297 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.08 
 
 
279 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  40.46 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.69 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.85 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.02 
 
 
284 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.46 
 
 
279 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.69 
 
 
279 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.69 
 
 
279 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  40.15 
 
 
264 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  39.46 
 
 
279 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  39.31 
 
 
279 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  39.31 
 
 
279 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  39.69 
 
 
279 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  39.85 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.4 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  40.98 
 
 
310 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  38.7 
 
 
294 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.46 
 
 
285 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.02 
 
 
275 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.08 
 
 
291 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.08 
 
 
278 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  41.83 
 
 
262 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.59 
 
 
279 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.06 
 
 
307 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  33.46 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  39.62 
 
 
288 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.26 
 
 
313 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.26 
 
 
313 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.78 
 
 
299 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.17 
 
 
279 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  37.55 
 
 
276 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.28 
 
 
320 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.62 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.92 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.08 
 
 
294 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.88 
 
 
311 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.88 
 
 
316 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.88 
 
 
311 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.88 
 
 
311 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.88 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.88 
 
 
310 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.54 
 
 
282 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.88 
 
 
310 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.55 
 
 
323 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.79 
 
 
301 aa  149  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.74 
 
 
282 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.12 
 
 
353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.4 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  36.88 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.12 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  36.56 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  36.5 
 
 
315 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  36.5 
 
 
316 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.5 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.5 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.5 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.92 
 
 
301 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  37.16 
 
 
286 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.25 
 
 
291 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.4 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  36.69 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.5 
 
 
286 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  35 
 
 
311 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  33.83 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  33.82 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  34.85 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3531  tryptophan 2,3-dioxygenase  33.46 
 
 
298 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0960  Tryptophan 2,3-dioxygenase  49.63 
 
 
369 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0143  tryptophan 23-dioxygenase  30.15 
 
 
298 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  30.63 
 
 
237 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02822  tryptophan 2,3-dioxygenase  46.03 
 
 
362 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01755  putative tryptophan-2,3-dioxygenase oxidoreductase protein  47.29 
 
 
369 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6248  tryptophan 23-dioxygenase  35.15 
 
 
294 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0410  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like  27.71 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  32.7 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5980  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  29.96 
 
 
296 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5416  tryptophan 23-dioxygenase  27.11 
 
 
295 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0225  Tryptophan 2,3-dioxygenase  39.06 
 
 
381 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1409  tryptophan 2,3-dioxygenase  43.1 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.932006  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1013  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  29.48 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0539  hypothetical protein  28.11 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0731  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  28.36 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02610  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  38.14 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0260  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)  38.66 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  28.57 
 
 
441 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  27.31 
 
 
409 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>