69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3510 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  880    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  49.51 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  27.7 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.07 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  28.57 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.99 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  25.99 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  25.99 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.64 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.64 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.64 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  25.55 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.07 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.89 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  29.05 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.86 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.07 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.64 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.55 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.81 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  25.75 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.38 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  27.27 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  25.43 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.86 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.35 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.66 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  24.56 
 
 		 279 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.21 
 
 		 265 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  26.81 
 
 		 276 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  24.56 
 
 		 279 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  24.35 
 
 		 279 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.79 
 
 		 311 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.11 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.64 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.12 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  23.67 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.38 
 
 		 307 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  21.15 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.75 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.26 
 
 		 301 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.58 
 
 		 291 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.57 
 
 		 282 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  27.22 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.58 
 
 		 278 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  22.91 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  22.71 
 
 		 294 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.14 
 
 		 284 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  22.77 
 
 		 264 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.67 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.93 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  25.65 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  34.41 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.28 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.83 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  28.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.07 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.15 
 
 		 285 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  36.56 
 
 		 310 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>