97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2226 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  68.86 
 
 		 307 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  61.97 
 
 		 279 aa  338  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.55 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  58.84 
 
 		 316 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  58.84 
 
 		 311 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.84 
 
 		 353 aa  314  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  58.43 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  58.48 
 
 		 315 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.48 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.48 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.48 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.3 
 
 		 282 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.84 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.16 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.16 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.58 
 
 		 299 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.94 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.3 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.21 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.25 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.89 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.69 
 
 		 313 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.09 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.99 
 
 		 311 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.09 
 
 		 311 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.09 
 
 		 311 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.23 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.99 
 
 		 310 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  58.96 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.14 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.3 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.2 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  57.84 
 
 		 288 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.64 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  51.11 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.74 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.37 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.37 
 
 		 279 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.99 
 
 		 275 aa  285  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.37 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  50.37 
 
 		 279 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.37 
 
 		 279 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  50 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  50 
 
 		 279 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  50 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  50 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  51.31 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  48.19 
 
 		 286 aa  271  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.06 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  49.45 
 
 		 280 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  49.43 
 
 		 291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  50.94 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  46.01 
 
 		 285 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  48.06 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  47.1 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  44.81 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  47.04 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  45.86 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  42.49 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  43.01 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  41.15 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  41.89 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  41.54 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  41.92 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  40.45 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  37.31 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  40.22 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.21 
 
 		 629 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  36.5 
 
 		 295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  37.31 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  34.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6248  tryptophan 23-dioxygenase  38.35 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  37.22 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  37.59 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  33.33 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3531  tryptophan 2,3-dioxygenase  35 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.16 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0143  tryptophan 23-dioxygenase  35.11 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  38.41 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  33.84 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5980  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  28.88 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5416  tryptophan 23-dioxygenase  30.23 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  29.66 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0960  Tryptophan 2,3-dioxygenase  41.9 
 
 		 369 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02822  tryptophan 2,3-dioxygenase  35.93 
 
 		 362 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01755  putative tryptophan-2,3-dioxygenase oxidoreductase protein  44.44 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0225  Tryptophan 2,3-dioxygenase  37.14 
 
 		 381 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0260  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)  39.57 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0410  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like  27 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1409  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.17 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.932006  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02610  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  39.19 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1013  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  39.83 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0539  hypothetical protein  25.87 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0731  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  37.5 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  24.12 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  24.24 
 
 		 409 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>