156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9109 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  100 
 
 
323 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  72.95 
 
 
336 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  72.17 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.67 
 
 
629 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  57.1 
 
 
342 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  50.6 
 
 
339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  52.45 
 
 
341 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  52.62 
 
 
334 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  49.24 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  52.29 
 
 
333 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  50 
 
 
337 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  36.7 
 
 
345 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  42.67 
 
 
342 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  39.22 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.95 
 
 
350 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  34.68 
 
 
312 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
372 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.64 
 
 
351 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.55 
 
 
346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.03 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  35.03 
 
 
358 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
323 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
333 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  31 
 
 
364 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.43 
 
 
358 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.2 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  30.82 
 
 
291 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
319 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.65 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  32.43 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.42 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  30.31 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
358 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  31.98 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.34 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.04 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  29.87 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  27.71 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.34 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.84 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25.78 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.81 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.28 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  22.41 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  21.77 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  21.77 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.18 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.55 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  30.17 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  29.5 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.17 
 
 
341 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.02 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
444 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
409 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  28.95 
 
 
392 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  22.74 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.8 
 
 
365 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
368 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
409 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
409 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
409 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  30.05 
 
 
413 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
389 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>