211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0847 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 350 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  46.29 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  42.56 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  38.34 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  42.18 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  35.63 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.97 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.95 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.9 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.62 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.03 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  34.36 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.63 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  30.45 
 
 		 629 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.21 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.55 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.66 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.8 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.31 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.18 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  31.15 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.5 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.58 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.42 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.62 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  32.68 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.97 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  29.92 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.35 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  29.13 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  29.76 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  31.08 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.62 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.51 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.65 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  25.41 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.81 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  28.17 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.19 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  22.97 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>