139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1472 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 334 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  86.85 
 
 		 341 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  74.54 
 
 		 333 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  69.82 
 
 		 334 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  66.06 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  58.54 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.32 
 
 		 629 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  50 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.62 
 
 		 323 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  51.84 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  51.69 
 
 		 361 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  36.39 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35.62 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.92 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.24 
 
 		 383 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.93 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  34.53 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.82 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  30.41 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.51 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.63 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.19 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.67 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.01 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.8 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  30.03 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.4 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  29.75 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.34 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.71 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.61 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  24.91 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.52 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.39 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 394 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.76 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>