214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2313 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  100 
 
 		 353 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  37.68 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.94 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  35 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  31.33 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.38 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  28.85 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  30.8 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  29.49 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.19 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  31.79 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  33.98 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.74 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  30.61 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  30.85 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  32 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.83 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.72 
 
 		 629 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.47 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  23.63 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  28.91 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  28 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  27.08 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  30.92 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.47 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.21 
 
 		 335 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.81 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.61 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.03 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  28 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.57 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  31.98 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.17 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.92 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.59 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.58 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  33.87 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.75 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.52 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.67 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  26.96 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.13 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.42 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.89 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  30 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  26.56 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.24 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  23.83 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.83 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  27.4 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  22.48 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  25.09 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  26.34 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>