177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0386 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  100 
 
 		 368 aa  758    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  34.96 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  30.52 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  30.52 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  30.52 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  30.75 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  28.45 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 399 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  27.91 
 
 		 437 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  29.21 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  28.27 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 431 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.08 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 447 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 435 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.13 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  28.73 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.63 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.18 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.77 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  21.62 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.94 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  29.95 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.93 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  22.2 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.2 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>