167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0533 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  100 
 
 		 378 aa  776    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  67.83 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  33.42 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  34.53 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  31.04 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  29.18 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  30.18 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  30.18 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  28.35 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.06 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  25 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  25 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  25 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.13 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.36 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  28.86 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  25.43 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.52 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  21.62 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  29.14 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.28 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.52 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  23.66 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.86 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  23 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.6 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.42 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.03 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.95 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  24.45 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  21.96 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  21.96 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.25 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  21.96 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>