40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2490 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  100 
 
 
370 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  86.87 
 
 
370 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  86.87 
 
 
370 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  86.87 
 
 
370 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  87 
 
 
377 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
380 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  28.49 
 
 
380 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  28.11 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  31.87 
 
 
366 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.4 
 
 
365 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  21.29 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.82 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  23.55 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
339 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  22.08 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.51 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
399 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  19.62 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.49 
 
 
351 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>