36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3223 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  100 
 
 
347 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
370 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
370 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
370 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
370 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
377 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  34.65 
 
 
366 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  30.15 
 
 
386 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.14 
 
 
365 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  23.78 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  24.93 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
380 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
378 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
357 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.82 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  22.32 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  21.84 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.35 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
319 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  22.52 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
339 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>