34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4164 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  85.64 
 
 
370 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  87 
 
 
370 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  85.64 
 
 
370 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  100 
 
 
377 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  85.64 
 
 
370 aa  668    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  28.5 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
380 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
380 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
380 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
386 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
347 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  31.14 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
393 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.42 
 
 
365 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  22.75 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.96 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.68 
 
 
339 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
378 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  22.55 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  21.79 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.12 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.69 
 
 
351 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>