90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6338 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  100 
 
 
393 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  30.89 
 
 
380 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  31.69 
 
 
366 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
380 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  33.15 
 
 
365 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  32.17 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
378 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
386 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
370 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
370 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
370 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  32.53 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  25.96 
 
 
377 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
351 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
372 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  21.77 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.74 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  24.79 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  25 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
326 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
409 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.3 
 
 
358 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
326 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.43 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.64 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  22.51 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  21.85 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.28 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  25.93 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  22.48 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
447 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.47 
 
 
339 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
435 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
391 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  23.74 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.88 
 
 
342 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.86 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  23.83 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  19.84 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  22.43 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  24.21 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>