32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3916 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3916  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  940    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0184862  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1529  hypothetical protein  34.08 
 
 
410 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0566823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1624  hypothetical protein  34.08 
 
 
410 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1534  hypothetical protein  35.51 
 
 
409 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.683625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2340  hypothetical protein  33.52 
 
 
410 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1549  hypothetical protein  28.03 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0052  hypothetical protein  27.86 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.567033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0489  hypothetical protein  28.61 
 
 
496 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2434  hypothetical protein  30 
 
 
442 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000516263  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2537  hypothetical protein  27.49 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.09358  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0973  hypothetical protein  26.04 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120678  normal  0.0416317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3053  hypothetical protein  28.73 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06466  hypothetical protein  25.57 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0198  hypothetical protein  25.91 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000606  zinc-regulated TonB-dependent outer membrane receptor  25.14 
 
 
380 aa  77  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3517  hypothetical protein  27.4 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0566  hypothetical protein  25.13 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3464  hypothetical protein  25.13 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0565  hypothetical protein  25.13 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3311  hypothetical protein  24.37 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00394375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0564  hypothetical protein  25.77 
 
 
329 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3742  hypothetical protein  23.71 
 
 
394 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3799  hypothetical protein  24.35 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0348341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0527  hypothetical protein  34.51 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3716  hypothetical protein  35.19 
 
 
395 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3925  hypothetical protein  23.71 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00111259  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0526  hypothetical protein  23.71 
 
 
394 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000343561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0447  hypothetical protein  25.81 
 
 
401 aa  56.6  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000225719  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4334  hypothetical protein  33.1 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3142  hypothetical protein  34.55 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.825348  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0616  hypothetical protein  22.99 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000317994  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>