135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3688 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  82.14 
 
 		 396 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  83.16 
 
 		 396 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  100 
 
 		 394 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  69.79 
 
 		 392 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  69.19 
 
 		 392 aa  581  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  66.24 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  61.62 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  61.36 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  61.36 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  61.36 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  61.1 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  60.4 
 
 		 409 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  60.15 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  58.4 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  58.4 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  58.15 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  56.85 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  47.41 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  44.62 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  47.3 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  45.99 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  39.85 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  37.84 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  37.84 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  37.84 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  37.34 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  38.56 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.72 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  23.9 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 429 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 395 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.17 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  25 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  22.33 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.06 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.06 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.53 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.09 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.95 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  21.96 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.04 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  24.13 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.88 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  20 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  20 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  20 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  20.65 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  21.43 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.55 
 
 		 341 aa  67  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  21.43 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  21.19 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  20.9 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  23.17 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  24.68 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  20.9 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  21.98 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  22.01 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  25.47 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.62 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.63 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  23.37 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>