133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4731 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  100 
 
 
433 aa  892    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  82.1 
 
 
421 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  78.28 
 
 
421 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  58.01 
 
 
420 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  57.77 
 
 
418 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  56.31 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  54.87 
 
 
420 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  54.87 
 
 
420 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  54.87 
 
 
420 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  54.85 
 
 
420 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  49.76 
 
 
429 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  47.29 
 
 
435 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  48.3 
 
 
447 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  48.54 
 
 
426 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  48.54 
 
 
426 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  48.06 
 
 
431 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  46.59 
 
 
434 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  46.65 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  46.65 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  46.65 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  45.95 
 
 
428 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  45.02 
 
 
437 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  43.07 
 
 
437 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  42.47 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  43.35 
 
 
437 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  40.53 
 
 
400 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
388 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  37.98 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  36.22 
 
 
401 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  38.36 
 
 
390 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  36.44 
 
 
398 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  36.6 
 
 
398 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  30.83 
 
 
403 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
374 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
391 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.53 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
397 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
367 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  35.78 
 
 
206 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
391 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  43.85 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
414 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
362 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
389 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
372 aa  96.3  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
378 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.63 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  22.79 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.5 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.5 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.29 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  21.91 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.6 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.91 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.05 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
392 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.14 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.45 
 
 
365 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.07 
 
 
350 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.6 
 
 
337 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  20.8 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  21.3 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.85 
 
 
378 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.95 
 
 
342 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
351 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.88 
 
 
346 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  20.72 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>