182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4262 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  37.64 
 
 
366 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  34.53 
 
 
378 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
380 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  33.15 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
380 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  32.7 
 
 
386 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  30.59 
 
 
372 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
357 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3685  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3698  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4164  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
377 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3223  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
347 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2490  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
370 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
336 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  30.9 
 
 
399 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.62 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
403 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.6 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  28.45 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  29.22 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  29.22 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  29.43 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.48 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.29 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.29 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  30.49 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.17 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  28.4 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.35 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.58 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25.61 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  21.05 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  27.71 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
336 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22.73 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
431 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
429 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.07 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.74 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  28.1 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>