129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1969 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  100 
 
 		 429 aa  895    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  52.16 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  28.93 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  30.3 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.95 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 435 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  30.24 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  26.68 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.37 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.25 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  26.11 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  28.64 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 378 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 392 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 396 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 396 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 396 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  27.63 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  27.63 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.72 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.45 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.37 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.18 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.57 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  22.12 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.45 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.73 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  22.81 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25.28 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>