134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0383 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  100 
 
 
413 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  72.48 
 
 
409 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  93.7 
 
 
413 aa  806    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  47.68 
 
 
396 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  47.06 
 
 
396 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  46.21 
 
 
409 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  46.06 
 
 
409 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  46.06 
 
 
409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  46.06 
 
 
409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  46.02 
 
 
394 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  45.22 
 
 
396 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  43.86 
 
 
392 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  46.19 
 
 
409 aa  349  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  44.01 
 
 
392 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  43.77 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  42.56 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  42.56 
 
 
396 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  42.56 
 
 
396 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  40.47 
 
 
395 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  35.58 
 
 
404 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  36.86 
 
 
392 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  35.11 
 
 
408 aa  246  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
415 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  35.62 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  35.37 
 
 
401 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  35.37 
 
 
401 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  32.49 
 
 
399 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  32.01 
 
 
410 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
404 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  29.64 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
397 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.26 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  22.44 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.6 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  21.74 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  22.1 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  23.46 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.54 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  24.58 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.08 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  24.68 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  21.47 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.66 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.95 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  21.02 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  21.98 
 
 
431 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  21.7 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
437 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  21.7 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.17 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.47 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  20.16 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  19.78 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  21.47 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  24.9 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>