134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4702 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  100 
 
 		 374 aa  767    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  47.31 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  30.85 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  30 
 
 		 367 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  28.65 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  30.98 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  31.02 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 400 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  28.76 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  27.39 
 
 		 437 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.26 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  28.97 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  28.61 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 429 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  26.43 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  30.17 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  20.63 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  22.2 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  22.76 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.57 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  21.9 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.79 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.44 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  23.65 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  20.99 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  25.77 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>