148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4742 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  82.14 
 
 		 394 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  100 
 
 		 396 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  81.06 
 
 		 396 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  72.21 
 
 		 392 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  70.98 
 
 		 392 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  68.88 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  62.95 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  62.95 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  62.44 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  62.69 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  62.69 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  60.2 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  59.95 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  60.2 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  60.2 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  59.7 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  58.67 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  47.81 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  45.04 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  48.08 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  47.06 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  37.86 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  39.14 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  37.56 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  37.88 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  35.32 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  35.63 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  30.26 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.25 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  26.37 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  23.95 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  23.72 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.94 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.65 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.94 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  23.28 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  23.83 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.12 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.33 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.26 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.7 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  23.61 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  23.75 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  24.06 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.23 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.77 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>