118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7182 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  100 
 
 
400 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  62.02 
 
 
392 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  59.9 
 
 
392 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  57.14 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  56.74 
 
 
396 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  56.74 
 
 
396 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  58.67 
 
 
396 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  56.74 
 
 
396 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  56.74 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  56.19 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  56.85 
 
 
394 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  56.3 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  51.99 
 
 
409 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  51.99 
 
 
409 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  52.26 
 
 
409 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  51.99 
 
 
409 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  51.49 
 
 
409 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  43.97 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  43.04 
 
 
395 aa  338  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  44.27 
 
 
413 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  43.88 
 
 
413 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  38.32 
 
 
408 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
401 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
401 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  37.47 
 
 
415 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
401 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  36.29 
 
 
404 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
392 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  31.59 
 
 
399 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  31 
 
 
404 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  30.67 
 
 
398 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
410 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.56 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  24.94 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  23 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.4 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  22.7 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.92 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  21.25 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  23.62 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  20.69 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.27 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
437 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  20.3 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  21.72 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  21.4 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  20.6 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  21.37 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  23.94 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  21.8 
 
 
437 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.12 
 
 
361 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  19.7 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  31.65 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  21.18 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.83 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  20.8 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  21.14 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.33 
 
 
339 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.63 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  20.3 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  20.69 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.76 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.23 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  20.44 
 
 
420 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  21.5 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  22.68 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  21.75 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  20.32 
 
 
401 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  20.68 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>