168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3322 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  100 
 
 
395 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  39.6 
 
 
403 aa  295  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  41.93 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  38.5 
 
 
393 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  40.52 
 
 
391 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  36.05 
 
 
397 aa  259  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  38.66 
 
 
391 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
388 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
402 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
401 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  31.54 
 
 
390 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
421 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
426 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
426 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
421 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  31.19 
 
 
400 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.32 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
421 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
420 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
420 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  28.8 
 
 
420 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  29.21 
 
 
428 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  26.33 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
435 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
444 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
378 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
420 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
398 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
402 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
367 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.36 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.48 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  24.25 
 
 
429 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  33.83 
 
 
206 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
409 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4635  hypothetical protein  65.22 
 
 
90 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.8 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.88 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.11 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.87 
 
 
362 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  24.38 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
409 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.61 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  27.36 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.15 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  22.73 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  22.78 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.65 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  21.28 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  21.09 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  21.09 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  21.09 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  30.77 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  25.24 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.37 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  24.6 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.25 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.25 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>