151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3602 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  52.16 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  33.25 
 
 
399 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
428 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
389 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  30.92 
 
 
378 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  28.45 
 
 
368 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
431 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
388 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
432 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
432 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  29.95 
 
 
432 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  28.5 
 
 
434 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
426 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
426 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
447 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  30.21 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  28.39 
 
 
435 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
390 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
421 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  27.13 
 
 
400 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
433 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  27.25 
 
 
437 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  26.08 
 
 
390 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  26.08 
 
 
390 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  26.08 
 
 
390 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  27.44 
 
 
437 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
421 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  30.87 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
387 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
418 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  27.51 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
444 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
401 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
398 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.58 
 
 
397 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
441 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
414 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  29.59 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  30.26 
 
 
396 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
437 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
392 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
394 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  28 
 
 
392 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.06 
 
 
378 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
362 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
396 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.24 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  30.6 
 
 
395 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.33 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.6 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.49 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  28 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  24.73 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  28.96 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.82 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.2 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>