142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1617 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  100 
 
 		 389 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  41.16 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  39.84 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  39.84 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  39.84 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  40 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  34.96 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  29.62 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  30.75 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.06 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  24.45 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  23.96 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  24.16 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 398 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  24.67 
 
 		 421 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  27.91 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.32 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.01 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.65 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.68 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.58 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.26 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.33 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  21.79 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.19 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.4 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.55 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  25 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.15 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  22.59 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.89 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  23.2 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  20.39 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>