143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2692 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  100 
 
 
392 aa  800    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  55.56 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  55.56 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  55.81 
 
 
401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  54.96 
 
 
415 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  54.57 
 
 
408 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  43.93 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
395 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  40.25 
 
 
399 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  39.49 
 
 
396 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
396 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
396 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  40.05 
 
 
396 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  41.03 
 
 
396 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  39.85 
 
 
394 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
396 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
396 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  39.23 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  37.98 
 
 
392 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  37.37 
 
 
392 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  37.91 
 
 
409 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  37.91 
 
 
409 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  37.91 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  36.02 
 
 
409 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  37.6 
 
 
409 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  38.69 
 
 
404 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
409 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  36.86 
 
 
413 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  36.6 
 
 
413 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  33.16 
 
 
398 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25.62 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
391 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
362 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
397 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  25 
 
 
378 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25 
 
 
367 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.06 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  24.94 
 
 
444 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  24.8 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
437 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.33 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  23.72 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
398 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  23.29 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.83 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  25 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.14 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  22.96 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.71 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  24.63 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  21.87 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.53 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6338  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.35 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  24.26 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
420 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.42 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>