116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6836 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  100 
 
 		 399 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  46.7 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  40.25 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  37.25 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  36.59 
 
 		 408 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  37.34 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 392 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  35.32 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  35.77 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  32.07 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  33.5 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  34.56 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  33 
 
 		 409 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  32.24 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  32.66 
 
 		 396 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  32.66 
 
 		 396 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  31.99 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  34.47 
 
 		 409 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  31.59 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  25 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.87 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  24.16 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  24.94 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.67 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 378 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  22.11 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  29.5 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  24.61 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  22.17 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.35 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.06 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.5 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  22.62 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  25 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  23.01 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.86 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  21.5 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  23.51 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  21.26 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  21.2 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  21.79 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.28 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.9 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  21.79 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  22.85 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  25.48 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  22.84 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  21.63 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  22.12 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  24.61 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  21.72 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.39 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  27.51 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  26.89 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  23.31 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.49 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>