163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5311 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  100 
 
 		 325 aa  677    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  73.46 
 
 		 326 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  73.46 
 
 		 326 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  56.4 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  48.94 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  46.81 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  43.2 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  46.62 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  41.74 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  42.77 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  40.92 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  40.31 
 
 		 317 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  39.81 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  36.42 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  36.39 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  33.11 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  33.43 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  35.06 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  32.27 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  27.68 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  31.29 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  30 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.18 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 313 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.02 
 
 		 361 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 353 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.69 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  29.5 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  31.76 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.3 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.85 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.67 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  28.57 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  31.28 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.15 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.87 
 
 		 365 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.79 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.99 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.31 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.37 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.13 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.11 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.8 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.8 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.91 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  26.06 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.38 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.87 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  21.4 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.12 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  26.36 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.38 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  25.33 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.37 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.18 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.33 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.46 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  25.41 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.31 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.15 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.79 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>