127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3792 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  89.73 
 
 
409 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  89.73 
 
 
409 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  88.26 
 
 
409 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  89.49 
 
 
409 aa  771    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  100 
 
 
409 aa  841    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  59.95 
 
 
396 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  60.4 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  58.38 
 
 
392 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  58.23 
 
 
392 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  60.05 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  57.84 
 
 
396 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  53.4 
 
 
396 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  53.4 
 
 
396 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  52.34 
 
 
396 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
396 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  53.14 
 
 
396 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  51.49 
 
 
400 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  46.02 
 
 
409 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  48.07 
 
 
413 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  47.04 
 
 
413 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  46.68 
 
 
395 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  39.2 
 
 
401 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  39.2 
 
 
401 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
415 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  39.2 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  38.38 
 
 
408 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  36.22 
 
 
404 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  37.4 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
399 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
404 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
398 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
410 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
391 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
362 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
397 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
391 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
403 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.8 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.53 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
437 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  22.92 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
393 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0907  hypothetical protein  24.85 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  22.31 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3224  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000120093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.78 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  22.17 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3654  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  22.41 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  23.54 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  22.35 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  24.51 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  21.75 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  22.4 
 
 
421 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  23.5 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.7 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  20.95 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.04 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
368 aa  63.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
354 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  22.19 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.49 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  22.93 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  26.12 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
429 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  20.05 
 
 
418 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  20.45 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>