126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3645 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  100 
 
 		 387 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  47.31 
 
 		 374 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  32.28 
 
 		 378 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  28.61 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  27.15 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  27.6 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.23 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  24.93 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  23.1 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.32 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.38 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  23.36 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  27.68 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  23.48 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  26 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.38 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  25.06 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  22.77 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  24.21 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.35 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  32.68 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.6 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.52 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>