204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3500 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  100 
 
 		 339 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  51.52 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  51.96 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  50.61 
 
 		 330 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  54.05 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  48.94 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  49.7 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  46.25 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  45.23 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  45.12 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  46.18 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  39.47 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  39.82 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  39.45 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  40.11 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  35.33 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  41.49 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  33.92 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  29.97 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.12 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.85 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  28.62 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.87 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.07 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.69 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.91 
 
 		 629 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.72 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.21 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.52 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.8 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.62 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.86 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  27.53 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.84 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.2 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  25.71 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.2 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.55 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.9 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  24.92 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.33 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  27.09 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.55 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.93 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.52 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  29.55 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  26.1 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.49 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.9 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  25.15 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.22 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.17 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  24.26 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  23.17 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3758  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>