116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2721 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
356 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  41.85 
 
 
316 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  40.63 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  41.27 
 
 
313 aa  215  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
366 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  39.81 
 
 
315 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  40.32 
 
 
321 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  38.87 
 
 
363 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  36.62 
 
 
312 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 
367 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  29.94 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  29.26 
 
 
336 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.89 
 
 
350 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.35 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.49 
 
 
351 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.76 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.55 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.88 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.85 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  29.28 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.37 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.09 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  31.56 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  28.18 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.04 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.38 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.34 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  26.8 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.23 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.6 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.24 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.47 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.84 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.2 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.61 
 
 
629 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.33 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.88 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.62 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.48 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.48 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.69 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.03 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.09 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.39 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  25.27 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
261 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  22.52 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  20.21 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  20.23 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  20.23 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.65 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  24 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  21.93 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.55 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.34 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  22.6 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.45 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.01 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  22.12 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  39.39 
 
 
108 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.92 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  21.18 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  19.92 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>