114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2954 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  100 
 
 
316 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  63.58 
 
 
316 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  58.79 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  48.24 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  50.16 
 
 
315 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  40.63 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  40.63 
 
 
366 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  41.27 
 
 
367 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  35.99 
 
 
363 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  38.1 
 
 
312 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  34.45 
 
 
337 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  36.27 
 
 
323 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  28.22 
 
 
326 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.42 
 
 
339 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
350 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
358 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  29.35 
 
 
320 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.74 
 
 
364 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27 
 
 
351 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.74 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.05 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
317 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
326 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.31 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  23.74 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.84 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  27.2 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.87 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  23.29 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  27.93 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.03 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.46 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.24 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.12 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.67 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  26.67 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.6 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  26.36 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.33 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.14 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.29 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.44 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.57 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.4 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.8 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.43 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.75 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  20.63 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.36 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.62 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  22.37 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
326 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25 
 
 
362 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  26.25 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  21.64 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  22.01 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.12 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6616  hypothetical protein  34.12 
 
 
108 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.01 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  22.38 
 
 
263 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  22.98 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.01 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  24.71 
 
 
340 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.78 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7921  hypothetical protein  26.1 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>