85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3899 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  100 
 
 
316 aa  613  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  42.32 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  34.02 
 
 
358 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.59 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  30.68 
 
 
354 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.91 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.05 
 
 
383 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.91 
 
 
372 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.3 
 
 
345 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.2 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.33 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.05 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.86 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.89 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.32 
 
 
334 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  33.49 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.89 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.93 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.57 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  24.47 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.18 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.69 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.79 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.67 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.27 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.8 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  30 
 
 
629 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  28.1 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.2 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.21 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.43 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  26.61 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  23.97 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  20.75 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.87 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  23.67 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  28.93 
 
 
392 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.05 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.54 
 
 
339 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  25 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
358 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
392 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  29.58 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
336 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.54 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  26.45 
 
 
409 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  23.3 
 
 
361 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.21 
 
 
283 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
326 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.11 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.1 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.32 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  30.69 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  24.14 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
409 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
404 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  23.9 
 
 
341 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>