105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4717 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 
358 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  51.38 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.8 
 
 
339 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  37.45 
 
 
372 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  36.06 
 
 
358 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
354 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  33.45 
 
 
345 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.5 
 
 
350 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.78 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.63 
 
 
341 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.82 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.5 
 
 
629 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
336 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  33.04 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  29.03 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  35.91 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.43 
 
 
323 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.53 
 
 
333 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  29.64 
 
 
364 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
333 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.23 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.49 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.9 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  31.68 
 
 
312 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.88 
 
 
351 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
336 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.36 
 
 
335 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
350 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.76 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  31.71 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  30.03 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
358 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  30.03 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.78 
 
 
330 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
317 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  29.01 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  32.68 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  27.45 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  28.15 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  30.4 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.56 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  29.69 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.26 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  29.2 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  23.21 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.74 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  30.73 
 
 
336 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  27.65 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  27.55 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.72 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  21.67 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  23.33 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  26.62 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.86 
 
 
362 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  22.62 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  32.69 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
368 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  24.36 
 
 
391 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  19.82 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  25.21 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
397 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  36.7 
 
 
258 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
409 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  22.29 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  22.3 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  29.57 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>