69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4901 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 330 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.61 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.26 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  33.11 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.24 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  33.55 
 
 		 361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.68 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.03 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.54 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.1 
 
 		 629 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  28.1 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  29.85 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.21 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.89 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.65 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.87 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.08 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.33 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.14 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  34.87 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.25 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.63 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.29 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  29.84 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  32.28 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.98 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.41 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  30.46 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  33.86 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  29.12 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.17 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  28 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  30 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  22.37 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  26.77 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  22.44 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  22.44 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1289  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0237628  normal  0.372585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  25.84 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  25.6 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  29.46 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.64 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  22.7 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 402 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.23 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>