13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1289 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1289  amidohydrolase 2  100 
 
 		 297 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0237628  normal  0.372585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7921  hypothetical protein  50.17 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1287  amidohydrolase 2  52.35 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1318  amidohydrolase 2  47.64 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.05 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  29.67 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  21.74 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  28.45 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.25 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.49 
 
 		 383 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  20.62 
 
 		 350 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>