128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1931 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  100 
 
 
342 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  74.25 
 
 
341 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  48.41 
 
 
364 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  45.79 
 
 
361 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  44.6 
 
 
358 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.29 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
341 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
358 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
372 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  28.77 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  28.93 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
341 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
326 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.2 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  25.31 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
335 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.71 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  25.07 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  25.14 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  28.77 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.07 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  26.42 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.57 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.32 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  23.4 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  26.73 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  23.41 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.71 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.22 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.29 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  26.48 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  26.48 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  24.39 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.11 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.9 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.3 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  27.7 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  29 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.18 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25.63 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  27.6 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.99 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  27.09 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.99 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  25.86 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  29.11 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.67 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.18 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.27 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.69 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.93 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.14 
 
 
629 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  23.05 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  23.28 
 
 
334 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.96 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  27.5 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.96 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.4 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  26.89 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>