71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4449 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  100 
 
 		 342 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  92.98 
 
 		 342 aa  684    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  86.8 
 
 		 342 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  83.92 
 
 		 342 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  87.39 
 
 		 341 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  83.58 
 
 		 341 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  83.87 
 
 		 342 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  82.11 
 
 		 341 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  83.58 
 
 		 342 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  82.75 
 
 		 342 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  82.7 
 
 		 342 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  80.94 
 
 		 341 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  81.52 
 
 		 342 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  80.06 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  77.49 
 
 		 345 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  76.83 
 
 		 341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  75.37 
 
 		 341 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  73.39 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  63.82 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  63.5 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  64.91 
 
 		 340 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  61.11 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  63.74 
 
 		 339 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  62.57 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  63.99 
 
 		 335 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  60.12 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  54.07 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  34.53 
 
 		 337 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.12 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  24.72 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  31.12 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.32 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  20.6 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  21.4 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.51 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.54 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  23.26 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  23 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  20.93 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  21.67 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  21.75 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.59 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  22 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  22.82 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.03 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.26 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  23.79 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.21 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.62 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.81 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  21.1 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  22.27 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  22.57 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  22.44 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  23 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  23.97 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  27.69 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  22.52 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>