78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0168 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  100 
 
 		 345 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  83.92 
 
 		 342 aa  620  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  83.53 
 
 		 342 aa  617  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  82.35 
 
 		 342 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  80.59 
 
 		 342 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  80.29 
 
 		 342 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  80 
 
 		 342 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  77.49 
 
 		 342 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  80 
 
 		 341 aa  587  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  77.19 
 
 		 342 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  78.36 
 
 		 342 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  77.94 
 
 		 341 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  78.24 
 
 		 341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  77.35 
 
 		 341 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  77.06 
 
 		 341 aa  564  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  75.88 
 
 		 342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  73.24 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  67.25 
 
 		 342 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  67.35 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  66.77 
 
 		 349 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  64.31 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  62.65 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  63.72 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  64.62 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  61.63 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  61.61 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  57.85 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  34.43 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  35.36 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  35.69 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  27.94 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.56 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  23.6 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  25.91 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  22.14 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  21.39 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  23.92 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  21.43 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.95 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.89 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.16 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.45 
 
 		 278 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  23.01 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  24.52 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  28.97 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  23.37 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5506  twin-arginine translocation pathway signal  24.73 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  23.43 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  23.76 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  24.93 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  25.31 
 
 		 374 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  20.55 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  21.29 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.57 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  22.75 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.74 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  22.69 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  24.63 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  25 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  25.13 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>