158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1757 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  100 
 
 		 293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  40.29 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  39.19 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  37.55 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  30.31 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  36.19 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  32.08 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.62 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  39.86 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.95 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.54 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.65 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  30.53 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.9 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  26.72 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.45 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  27.71 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  30.73 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.45 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  29 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  30.65 
 
 		 884 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  30 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  27.52 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  27.34 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.48 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.41 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  32.8 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30.18 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  32.69 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  30.68 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  30.86 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6447  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469414  unclonable  4.69579e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  24.8 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  28.64 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.72 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.34 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>