77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  55.67 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  54.71 
 
 		 358 aa  292  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  51.44 
 
 		 333 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  52.13 
 
 		 297 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  51.42 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  47.72 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  53.6 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  49.29 
 
 		 884 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  46.45 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  47.14 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  49.83 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  46.01 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  46.76 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  35.08 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.73 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.42 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.73 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.42 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.45 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.13 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  31.41 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.79 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.19 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.68 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.09 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.5 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  41.27 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.95 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.33 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  32.5 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.6 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.44 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  30.16 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 287 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  21.86 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  21.8 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  23.6 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  25.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1996  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  21.74 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  24.07 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  28.8 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0363  amidohydrolase 2  32.56 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0638022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>