96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0424 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  100 
 
 
311 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  64.24 
 
 
308 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  62.63 
 
 
301 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  62.28 
 
 
285 aa  346  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  60.22 
 
 
884 aa  345  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  60.21 
 
 
333 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  60.14 
 
 
297 aa  342  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  54.55 
 
 
297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  53.15 
 
 
297 aa  309  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  53.9 
 
 
296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  52.94 
 
 
308 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  53.24 
 
 
358 aa  295  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  51.96 
 
 
309 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.72 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  30.47 
 
 
300 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
279 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.48 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  28.48 
 
 
385 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.48 
 
 
341 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  33.72 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.67 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.39 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.3 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  29.28 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  30 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  30.07 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  27.22 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.87 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.83 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.25 
 
 
288 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  23.65 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.34 
 
 
218 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.39 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  27.01 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
415 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  26.74 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.17 
 
 
308 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25 
 
 
277 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
280 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25 
 
 
277 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  25 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  22.8 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  29.45 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.49 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.87 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.85 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  39.06 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  29.49 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1447  hypothetical protein  23.14 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  23.66 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  22.54 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  20.77 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  23.01 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  25.33 
 
 
396 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>