32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3364 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  100 
 
 		 339 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  70.61 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  67.7 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  61.68 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0087  amidohydrolase 2  62.58 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655536  hitchhiker  0.0000125986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3030  hypothetical protein  60.37 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.911136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0537  amidohydrolase 2  35.25 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  25.96 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.2 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.33 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.22 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.06 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.15 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  23.96 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  23.58 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.73 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  24.48 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>